Missing coverage evidence...
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CCAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTG  >  minE/585012‑585072 |                                                             ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCATAAGACa                            >  1:1684246/1‑35 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACaa                           >  1:722725/1‑36 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGTAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:454908/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCaa                  >  1:1232338/1‑45 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:685014/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1796000/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1828201/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:290567/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:308913/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:424592/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:485426/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:504580/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:574409/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:600347/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1752086/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:724035/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:736356/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:737663/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:747418/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:769946/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:833847/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:857122/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:925870/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:964827/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1510325/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1047215/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:10816/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1108142/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1110346/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1162982/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1199988/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1322134/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1322174/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1328032/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1389173/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1014992/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1517553/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1534981/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1562536/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1570105/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1610831/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1627338/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1647239/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1727206/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:1733860/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCTTAAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTg  >  1:268359/1‑61 (MQ=255) |                                                             CCAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTG  >  minE/585012‑585072

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑