Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	662185	662561	377	61 [0]	[0] 96	[pyrD]	[pyrD]

TAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAC  >  minE/662562‑662606 |                                             tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTaagcgaagcg    >  1:305596/1‑43 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:478220/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:624592/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:621173/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:615819/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:606126/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:600894/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:591512/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:572299/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:560845/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:516069/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:514861/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:481890/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:647698/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:451703/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:443503/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:41541/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:410544/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:400951/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:381079/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:371880/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:359439/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:343515/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:29411/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:822761/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:992240/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:982191/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:968863/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:94584/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:925808/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:925371/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:917647/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:915313/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:875985/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:845364/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:844659/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:26755/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:806088/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:803807/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:776415/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:741769/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:734290/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:734268/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:731224/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:728746/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:725602/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:715888/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:694560/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1220133/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1018869/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1427111/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1420213/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1389364/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1379654/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1378763/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1307116/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1291146/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1278644/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:126726/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1266782/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1428892/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1219480/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1191913/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1167394/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1166163/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1116994/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1084893/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1082446/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1061994/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1023680/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1021519/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1021011/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1693668/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:199370/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1895074/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1877297/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1854499/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1850789/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1817038/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1811357/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1808946/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1800063/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1764655/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1733828/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1452203/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1677587/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1657576/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1651206/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1631473/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1624424/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1591438/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1582536/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1573217/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1492446/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1476091/1‑45 (MQ=255) tAGACATTTTGTACTTCTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAc  >  1:1365014/1‑45 (MQ=255) |                                             TAGACATTTTGTACTTTTATTGTTGAGGTTATTAAGCGAAGCGAC  >  minE/662562‑662606

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑