Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	693097	693148	52	5 [0]	[0] 60	hyaE	protein involved in processing of HyaA and HyaB proteins

CAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGA  >  minE/693149‑693210 |                                                              cAAGCGCCAGACGGCGTGGTTTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1898994/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGATGTCAGCGa  <  1:728321/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:654842/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:347358/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:366393/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:402985/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:405583/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:420422/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:48858/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:516417/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:57291/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:574039/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:588592/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:631286/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:634732/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:639613/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:651394/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:283699/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:679265/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:77818/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:794492/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:800923/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:881911/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:885075/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:887801/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:890086/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:918612/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:954226/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:958375/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:966676/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:98550/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1636192/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1114739/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1119705/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1131619/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1166503/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:11862/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1206929/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1228711/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1267589/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1315734/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1328875/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1493941/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1530757/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1552/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:16216/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1078384/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1699680/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1699971/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1722408/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1760029/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1778392/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1778741/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1782086/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1805107/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1838446/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:1897737/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:209602/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:214085/62‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGa  <  1:241476/62‑1 (MQ=255) |                                                              CAAGCGCCAGACGGCGTGGTGTTATTAAGCAGTGACCCGAAACGCACGCCAGAGGTCAGCGA  >  minE/693149‑693210

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑