Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	797455	797540	86	89 [0]	[0] 39	ycgY	hypothetical protein

ATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTA  >  minE/797541‑797602 |                                                              aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTTGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1230990/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttgtta  <  1:779466/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:724172/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:475723/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:483852/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:523394/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:578519/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:612406/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:642515/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:655329/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:708065/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:709505/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:353002/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:761123/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:775723/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:775766/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:815825/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:945594/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:965184/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:981826/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1763226/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1061180/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1155308/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1191835/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1226345/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1502209/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1512051/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1545391/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1595373/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:4524/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1791751/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1858513/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1873741/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:196323/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:290038/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:297533/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:326587/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1005267/62‑1 (MQ=255) aTGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGGCTGGATTATGTGAttatta  <  1:1204937/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTA  >  minE/797541‑797602

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑