Missing coverage evidence...
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TTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAA  >  minE/901853‑901913 |                                                             ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATgc                      >  1:1262097/1‑41 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1045571/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:893749/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:848082/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:825408/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:687610/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:618111/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:599392/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:495628/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:453150/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:452729/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:433370/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:381466/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:35266/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:201332/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1872506/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1801736/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1787339/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1714139/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1695642/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1694124/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1691133/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1577908/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1535266/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1469043/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1334895/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1303831/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1192032/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTaa  >  1:1018855/1‑61 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTa   >  1:648208/1‑60 (MQ=255) ttAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTa   >  1:972385/1‑60 (MQ=255) |                                                             TTAAATCAAAAATCGTGCTGTTATCAGCACTGGTTTCATGCGCCCTGATTTCAGGCTGTAA  >  minE/901853‑901913

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑