Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 980031 980453 423 6 [1] [0] 145 cspI cspI

Only 100 of 145 total aligned reads displayed.

CCATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTAA  >  minE/980454‑980499
|                                             
ccATTAACTCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:474627/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTACCCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1803348/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACTACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1303304/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1876683/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:443437/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:431956/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:37530/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:374322/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:369491/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:312030/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:279014/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:243078/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:241092/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:205045/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1001417/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1814110/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1813801/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1806783/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:179337/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1761752/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1743075/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1733426/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1724378/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1715977/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1686190/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1678231/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:687718/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:984743/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:982277/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:957910/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:956381/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:920106/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:891862/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:850117/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:817631/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:760363/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:729565/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:702708/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:494704/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:673144/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:662129/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:630631/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:629713/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:60276/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:561738/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:555865/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:530376/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:521889/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:519014/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:504807/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1124526/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1672103/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1284955/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1264290/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1252361/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1232419/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1226523/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1209488/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1180279/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1170785/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1160379/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1130155/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1287011/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:112233/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1115486/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1115003/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1111573/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1071279/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1067849/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1041945/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1040940/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1025343/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:101761/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1014048/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1467507/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1608717/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:160324/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1586096/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1574966/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1558512/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:155142/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1524039/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1515689/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1514521/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1292530/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1465968/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1443167/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1432808/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1428947/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1426888/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1416676/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1396987/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1387563/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1377687/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1373808/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1339600/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1294044/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGACTACTTTTGTaa  <  1:738458/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCAATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:1760853/46‑1 (MQ=255)
ccATTAACGCATGATTAACCACCAATAGCAAGGATTACTTTTGTaa  <  1:103130/46‑1 (MQ=255)
|                                             
CCATTAACGCATGATTAACCACCCATAGCAAGGATTACTTTTGTAA  >  minE/980454‑980499

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑