Missing coverage evidence...
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TACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCA  >  minE/994343‑994402 |                                                            tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTa      >  1:1417150/1‑56 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:1876237/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:985411/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:837254/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:832297/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:770562/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:714446/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:618435/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:476755/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:429572/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:418571/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:289190/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:262932/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:259844/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:214230/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:1077962/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:1692841/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:163308/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:161319/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:1551476/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:1523719/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:1482094/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:1475129/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:1379468/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:127829/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:1145547/1‑60 (MQ=255) tACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCa  >  1:1134203/1‑60 (MQ=255) |                                                            TACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCA  >  minE/994343‑994402

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑