Missing coverage evidence...
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TTGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCA  >  minE/1023178‑1023239 |                                                              ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:258038/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:955241/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:915158/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:831480/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:578100/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:560351/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:558511/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:552891/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:551029/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:48791/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:1100474/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:25426/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:216307/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:199329/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:1635133/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:1528204/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:1441460/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:1415486/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:1415132/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:1411737/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCa  <  1:1290080/62‑1 (MQ=255) ttGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGGGGTGTAGAGCa  <  1:814748/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTGCGCGACATGCGTCACCACGGTGATATCGTCCACCCAGGTGTTCGGCGTGGTGTAGAGCA  >  minE/1023178‑1023239

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑