Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1038614	1038618	5	14 [0]	[0] 42	rsxE	predicted inner membrane NADH‑quinone reductase

CTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCT  >  minE/1038619‑1038679 |                                                             cTGCCACTAAGGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:644471/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGCCGCTGACCAACCt  <  1:1557437/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:514885/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1866712/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:201807/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:22230/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:251277/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:312232/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:388716/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:392580/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:455208/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:471591/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1794002/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:597668/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:703681/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:715606/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:780977/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:798242/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:837320/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:877948/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:923814/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:993801/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1390094/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1050786/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1079459/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1092702/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1111970/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1163610/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1174961/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:125392/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1324793/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1343954/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1013929/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1444955/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1456562/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1535751/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1545735/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1547842/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:163079/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1700063/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1701688/61‑1 (MQ=255) cTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCt  <  1:1784102/61‑1 (MQ=255) |                                                             CTGCCACTAACGCTCTGGGTTTAGGACTTGCGACTACGCTGGTACTGACGCTGACCAACCT  >  minE/1038619‑1038679

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑