Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 86262 86514 253 8 [0] [1] 138 murC UDP‑N‑acetylmuramate:L‑alanine ligase

Only 100 of 138 total aligned reads displayed.

AGCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAC  >  minE/86514‑86574
 |                                                           
aGCCTGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:322219/61‑1 (MQ=255)
 gCCTGTGAATGGTATAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1317706/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:416316/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:607511/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:587904/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:58037/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:552624/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:524821/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:519124/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:490303/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:486264/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:472322/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:453834/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:448965/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:62453/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:415051/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:414366/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:391866/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:37529/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:363930/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:334754/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:249823/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:24606/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:24579/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:207957/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:20481/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:763698/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:981780/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:978939/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:973066/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:96048/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:942840/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:914760/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:906760/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:876151/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:875492/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:860278/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:810397/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:808361/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:614655/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:71835/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:716477/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:692114/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:69129/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:691152/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:687260/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:65879/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:649139/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:644227/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:634302/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:204545/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1248244/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1438625/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1437153/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1431693/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1430558/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1427591/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1424844/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1419793/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1410552/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1388550/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1337130/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1309899/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1281023/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1449360/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1244794/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1231910/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1191043/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:118799/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1173147/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:115223/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1094693/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1077967/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1064545/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1049268/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1034605/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1696300/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1869155/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1867550/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1838175/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1807986/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1803334/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1791065/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1790041/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1764062/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1748492/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1715289/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1700048/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1016013/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1682790/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1641325/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1624929/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1597076/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1554694/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1550243/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1538036/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1533366/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1505881/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1493713/60‑1 (MQ=255)
 gCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGACGACTACGGCCACCACCCGAc  <  1:1575193/60‑1 (MQ=255)
 |                                                           
AGCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGAC  >  minE/86514‑86574

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑