Missing coverage evidence...
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ACGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAT  >  minE/1123303‑1123364 |                                                              aCGGTAGCTGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1641702/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGc                           >  1:1132875/1‑37 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGAt           >  1:1194282/1‑53 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTa   >  1:1030943/1‑61 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTa   >  1:319262/1‑61 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTa   >  1:1595065/1‑61 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTa   >  1:1084644/1‑61 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTa   >  1:1382870/1‑61 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTa   >  1:345910/1‑61 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTa   >  1:510478/1‑61 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTa   >  1:360301/1‑61 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTa   >  1:363459/1‑61 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1886715/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1897408/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:189652/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1716896/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1842507/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1772204/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1621698/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:274842/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:473567/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:706583/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:829199/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:87081/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:885/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:937400/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:953589/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1296024/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1023039/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1024088/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1048234/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1050397/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1174194/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1178309/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1184314/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1266399/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1286815/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1661023/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:134256/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1415388/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1520555/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1538870/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1574979/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1581632/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1001083/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTAAt  >  1:1567897/1‑62 (MQ=255) aCGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGAGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:518500/1‑62 (MQ=255) aCGGAAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAt  >  1:1853539/1‑62 (MQ=255) |                                                              ACGGTAGCGGCAATCTCCTCTTCTTCGAGTGTACGGCTGGTATCTTGCAGGATCAGGCTTAT  >  minE/1123303‑1123364

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑