Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1173228	1173294	67	53 [1]	[0] 44	topB	DNA topoisomerase III

TGCTGCCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAATT  >  minE/1173295‑1173354 |                                                            tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:606366/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:259423/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:282519/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:290649/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:293676/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:298578/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:327115/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:474014/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:50975/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:538612/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:57665/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:226936/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:677272/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:703733/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:734057/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:737753/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:773041/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:776236/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:847811/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:911279/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:911594/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:993503/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1382580/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1020628/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1055692/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1058712/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1129048/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1155594/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1234552/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1258096/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1275263/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1317367/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1347643/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1015891/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1402645/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1495886/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1604405/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1609316/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1617615/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1715151/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:17244/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1754563/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:1849905/60‑1 (MQ=255) tgctgcCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAAtt  <  1:198657/60‑1 (MQ=255) |                                                            TGCTGCCTAACAGCGTGCGCCAGCCTGCTTCAGCAAGAAAACGCGCTTTAGCGACAAATT  >  minE/1173295‑1173354

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑