Missing coverage evidence...
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ACCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTC  >  minE/1207971‑1208023 |                                                     aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTg        >  1:88743/1‑47 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGtt   >  1:343691/1‑52 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGtt   >  1:631711/1‑52 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:638615/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:333857/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:354600/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:476695/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:490058/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:6205/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:622383/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:632413/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:633203/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:294838/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:645888/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:6484/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:683287/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:800484/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:865793/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:92420/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:931290/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:950396/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:990321/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:1613067/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:108030/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:1154405/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:1258426/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:141350/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:142026/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:1447491/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:1472628/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:1504795/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:1539716/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:154903/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:1061425/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:1706454/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:1799692/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:186213/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:1863421/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:1883059/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:213479/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:222186/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:255633/1‑53 (MQ=255) aCCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTc  >  1:262098/1‑53 (MQ=255) |                                                     ACCCTGAGAACAACGAAGCTCGTAAACAAGCTATTCGCCGTCACCTGGAGTTC  >  minE/1207971‑1208023

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑