Missing coverage evidence...
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ACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGA  >  minE/1215336‑1215397 |                                                              aCCACTCCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1420539/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTTGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:3460/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:757087/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:245710/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:250287/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:357142/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:455743/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:464382/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:514804/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:522808/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:542228/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:696567/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:722141/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:724410/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:20799/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:761644/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:764492/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:779987/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:798127/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:826116/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:883078/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:917727/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:927995/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:960119/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:995004/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:999064/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1528168/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1031221/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1088046/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1132183/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:116599/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1183996/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1217521/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1295549/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1344117/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:142228/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1445376/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1479279/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1590785/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:164656/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1665681/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1676212/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1681169/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1716529/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1721780/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1747179/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1806505/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1876483/62‑1 (MQ=255) aCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:20715/62‑1 (MQ=255) aCCACAACATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGa  <  1:1017514/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGA  >  minE/1215336‑1215397

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑