Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1226542	1226883	342	32 [0]	[0] 17	pphA	serine/threonine‑specific protein phosphatase 1

ATCAATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCT  >  minE/1226884‑1226944 |                                                             atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:1783613/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:994423/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:671137/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:537066/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:38739/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:37/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:364677/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:219353/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:1862472/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:1058204/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:175741/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:1538148/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:1375603/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:1136387/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:1114403/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:1091056/61‑1 (MQ=255) atcaATATTTTCCTCCCGAGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCt  <  1:1492451/61‑1 (MQ=255) |                                                             ATCAATATTTTCCTCCCGCGCTAAAGATCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCT  >  minE/1226884‑1226944

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑