Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	104380	104473	94	16 [0]	[0] 79	ampE	predicted inner membrane protein

ATTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGCA  >  minE/104474‑104535 |                                                              aTTGTGGGGGGAACCTTGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:744445/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATgggg                         >  1:89181/1‑39 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGc                    >  1:107988/1‑44 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGttt                >  1:1691936/1‑48 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTg             >  1:1769265/1‑51 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:419155/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:588254/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:586176/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:560306/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:541064/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:505665/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:498184/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:46633/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:428559/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:598700/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:417831/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:394167/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:386612/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:355459/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:350836/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:281729/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:218221/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:769733/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:999259/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:988399/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:959277/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:905835/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:870214/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:846932/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:820750/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:81946/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:589422/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:737512/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:715355/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:709813/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:699369/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:689908/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:676070/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:65624/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1871173/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1293048/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:19989/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1473479/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1462015/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1416360/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1414202/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1408305/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1359759/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1345470/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1297203/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:149527/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1274483/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1254570/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1191161/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1160419/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1157753/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1063890/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:105336/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1051143/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1529405/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1011202/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1834243/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1819861/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1798666/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1795455/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1769770/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:175952/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1724569/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1687235/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1681778/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:167438/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1669020/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1543977/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1530156/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:1513122/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGAGTGCATGGc   >  1:1103770/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTT‑CGTGCATGGCa  >  1:1718396/1‑61 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACCCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATgg    >  1:205120/1‑60 (MQ=255) aTTGTGGGGGGAACATGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGc   >  1:672871/1‑61 (MQ=255) |                                                              ATTGTGGGGGGAACCTGGGGACCCGTTACGCTGATGGGGTATGCGTTTTTGCGTGCATGGCA  >  minE/104474‑104535

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑