Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1250970	1252060	1091	47 [0]	[0] 77	[ruvC]–[yebC]	[ruvC],[yebC]

CTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGC  >  minE/1252061‑1252101 |                                         cTGCCATAAATATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1764030/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCGCTGCCTGTTCAGGc  <  1:133382/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:414444/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:626675/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:564744/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:542410/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:518259/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:514477/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:504455/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:472692/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:468773/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:428589/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:628911/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:414013/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:384942/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:351159/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:346996/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:330034/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:329277/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:306686/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:281321/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:863959/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:935359/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:931992/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:930944/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:919791/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:918768/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:916410/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:896173/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:8923/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:891361/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1863572/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:842342/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:824834/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:788432/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:783834/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:773954/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:714407/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:708341/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:705232/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1233450/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1382434/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1316714/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1312767/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1300683/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1274012/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1257513/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1256245/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1237276/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1233955/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1423773/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1218606/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1123329/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1083641/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1077901/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1077792/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1040785/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1024617/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1008332/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1446936/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1005699/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:18470/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1780914/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1747708/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1717977/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1688518/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1642481/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1640275/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1621435/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1607849/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1599751/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1514729/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1494741/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1491187/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1452411/41‑1 (MQ=255) cTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:249493/41‑1 (MQ=255) cTGCCAAAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGc  <  1:1632783/41‑1 (MQ=255) |                                         CTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGC  >  minE/1252061‑1252101

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑