Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1261952 1262039 88 105 [0] [0] 103 torY TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit

Only 100 of 103 total aligned reads displayed.

CCCTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAATAT  >  minE/1262040‑1262100
|                                                            
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGAGACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1217804/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACTGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:982948/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGATATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1500239/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:5599/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1793915/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:532938/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:50475/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:49490/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:475766/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:475591/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:459382/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:427381/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:383196/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:339095/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:334927/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:319631/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:239073/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:238940/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:230207/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:211669/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:206653/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1886570/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1871001/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1835771/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1827229/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:182548/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1750110/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:844572/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:956794/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:938755/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:934942/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:927506/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:919015/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:911871/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:901447/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:886409/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:879985/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:864875/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:855233/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:566511/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:83888/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:774554/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:678745/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:678099/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:653132/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:616792/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:605682/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:605220/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:58418/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:578574/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:577710/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1205396/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1394837/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1381548/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1370282/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1353637/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1323585/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1316699/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1313934/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1309017/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1291324/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1251983/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1244815/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1213479/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1408554/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1196402/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1192269/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1124898/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1116254/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1114095/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1103398/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1100008/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1090197/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1042450/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1028979/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1022373/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:15919/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1010425/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1743340/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1740426/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1726890/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1724815/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1701028/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1676686/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1672740/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1669885/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1606229/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1764951/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1575195/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1571173/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1552205/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1539597/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:153913/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1515868/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1515418/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1498635/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1464898/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1437026/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1424567/61‑1 (MQ=255)
cccTCGCATAGATTCCTCTAATTAAAATACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAatat  <  1:1721068/61‑1 (MQ=255)
|                                                            
CCCTCGCATAGATTCCTCTAATTAAATTACTGGACACCGAAATCATTGTATAATTAAATAT  >  minE/1262040‑1262100

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: