Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1276855	1276880	26	49 [0]	[0] 96	[serU]	[serU]

GCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGA  >  minE/1276881‑1276942 |                                                              gCCATTATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:540949/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGATATTTGGCATTTTTACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:455299/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAATTTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1766690/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTTGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:750537/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:346019/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:558125/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:498536/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:485462/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:460476/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:459591/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:414701/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:402952/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:397426/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:386268/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:384619/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:567330/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:34062/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:334602/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:325892/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:312259/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:295992/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:294458/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:284626/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1869928/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1855648/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:733036/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:970274/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:881999/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:88033/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:870571/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:83394/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:831834/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:821865/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:792312/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:781619/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:745493/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:737731/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1016428/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:71267/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:656537/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:639000/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:602217/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:599679/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:584637/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:584494/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:582077/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:570718/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:56785/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1396831/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1483228/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1479065/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1479002/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1468326/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1454546/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1453413/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1452042/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1425401/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1409012/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1407620/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1406902/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1490761/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1384913/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1320822/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1311180/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1293630/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1292803/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:129258/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1237704/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1196709/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1084804/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1004133/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1598214/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1831281/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:182501/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1787981/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1771425/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:175940/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1708472/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1704116/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1703551/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1699662/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:168195/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1625518/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1500669/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1572787/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:156939/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1565474/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1551201/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1548785/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1533394/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1529571/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1524379/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1517432/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGAGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1507743/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGCCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGa  <  1:1837286/62‑1 (MQ=255) gCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTCTCCGGGCAATATTGTTCAAGTGa  <  1:773832/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCCATGATGCCAGGAAATTTGGCATTTTAACAGTCCCTGTCCGTGCAATTTTGTTCAAGTGA  >  minE/1276881‑1276942

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑