Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1317595 1317737 143 90 [0] [0] 111 [cld] [cld]

Only 100 of 111 total aligned reads displayed.

ACATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCT  >  minE/1317738‑1317781
|                                           
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGGTCATCAACTTTTAAGCt  >  1:42613/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCTTCAACTTTTAAGCt  >  1:1325053/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCGACTTTTAAGCt  >  1:693408/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTaa     >  1:619935/1‑41 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAg    >  1:37295/1‑42 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGc   >  1:965882/1‑43 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGc   >  1:1358685/1‑43 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:631331/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:247584/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:5734/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:551276/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:538185/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:535770/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:533246/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:527134/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:518569/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:507760/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:463178/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:435278/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:434045/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:426313/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:413132/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:383359/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:377973/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:377954/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:310579/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:294278/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:215882/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:801775/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:961694/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:960822/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:937688/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:930978/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:929285/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:923231/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:908812/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:896440/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:87252/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:843519/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:80223/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:648626/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:795315/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:794837/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:790011/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:784396/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:759517/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:747830/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:697727/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:675739/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:675500/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:675331/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:118745/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:141855/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1400184/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1366389/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:132804/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1323371/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1308484/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1270849/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1268253/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1251403/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1245741/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1231189/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:12153/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1461307/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1185934/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1184533/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1161020/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:113921/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1138910/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1135023/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:112661/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1087512/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1054190/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1035961/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:103383/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1657802/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1007675/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:197459/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1852379/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1841724/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1824319/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1766308/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1763185/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:172558/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1688463/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1678333/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:222283/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1630864/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1613842/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1607676/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1587312/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1587080/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1585138/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1573257/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1557205/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1522210/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1509788/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCt  >  1:1507613/1‑44 (MQ=255)
acaTAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTAAAGCt  >  1:1783430/1‑44 (MQ=255)
|                                           
ACATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCT  >  minE/1317738‑1317781

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: