Missing coverage evidence...
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GTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAC  >  minE/1323998‑1324058 |                                                             gTATGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:620378/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1009995/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:253402/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:264268/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:269354/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:339798/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:386880/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:463599/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:472823/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:501830/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:51680/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:58690/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:624440/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:682122/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:720515/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:787694/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:83102/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:859811/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:913787/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:98015/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:987200/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1461423/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1015617/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1186/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1222290/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1232013/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1237548/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1238254/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1303685/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1411572/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1429502/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1449227/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:241438/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1473068/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1507488/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1630044/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1661146/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1714766/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1817638/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:1835503/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAc  <  1:219165/61‑1 (MQ=255) gTAAGATGGCGAAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCTCATGAc  <  1:323614/61‑1 (MQ=255) |                                                             GTAAGATGGCGTAATTAGCGTGGCTAACGGTCAGGTTATCGATGATCAGGTTGCGCATGAC  >  minE/1323998‑1324058

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑