Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1368678	1369049	372	31 [0]	[0] 54	dusC	tRNA‑dihydrouridine synthase C

CCCTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGT  >  minE/1369050‑1369111 |                                                              cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCccgc                     >  1:59627/1‑43 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAAcaga  >  1:610943/1‑59 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCg   >  1:1730695/1‑61 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:223805/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:210922/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:268749/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:362072/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:404208/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:441776/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:506529/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:516135/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:529555/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:536522/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:539429/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:55259/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:638149/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:646917/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:667723/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:701305/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:760661/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:779082/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:812/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:819372/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:83583/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:869531/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:879147/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:958638/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:95886/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1349668/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1056936/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1065294/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1090350/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1120296/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1135471/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1183362/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1207910/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1240278/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1241572/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1274884/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1319557/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1435177/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1442100/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1477322/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1486629/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1532686/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1567074/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:15729/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1608400/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:181289/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1894074/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:207809/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGACTAACGTc                            >  1:1503896/1‑36 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTAAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1007717/1‑62 (MQ=255) cccTGGTAGATGAGTTAAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGt  >  1:1268179/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCCTGGTAGATGAGTTCAGGATCTTTGAGTAACGTCGCCCCGCCGCCGCTACCGTTAACCGT  >  minE/1369050‑1369111

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑