Missing coverage evidence...
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AAGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAG  >  minE/1375815‑1375876 |                                                              aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTTCGCCGATATACGTCAg  <  1:860229/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:1893135/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:911228/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:90963/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:769447/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:75076/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:691332/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:471527/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:464476/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:442762/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:43677/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:193269/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:1049103/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:1861397/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:1817207/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:177897/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:1776703/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:1752807/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:169692/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:158197/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:1438231/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:1400939/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:1379934/62‑1 (MQ=255) aaGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAg  <  1:1216636/62‑1 (MQ=255) |                                                              AAGATAATAATCGCCCCTTTGATGATGTACTGCCAGTATGGGTTTACGCCGATATACGTCAG  >  minE/1375815‑1375876

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑