Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1443045	1443132	88	55 [0]	[0] 97	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

GGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAA  >  minE/1443133‑1443194 |                                                              ggATGTTACTTCGGCATAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:422021/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAAt            >  1:1190076/1‑52 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGt      >  1:766460/1‑58 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:387988/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:605774/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:596695/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:595037/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:571780/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:538668/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:536563/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:433927/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:432094/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:40363/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:397702/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:618409/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:37569/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:367510/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:339132/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:317836/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:311800/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:297277/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:280697/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:266528/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:240078/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1030236/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:809676/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:991937/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:95633/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:949418/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:932946/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:920785/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:916831/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:891290/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:861204/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:858769/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:832706/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:608716/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:768511/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:743818/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:740134/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:718165/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:70601/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:656193/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:629557/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:629341/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:619751/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:235386/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:123185/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:210325/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1410561/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1392809/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1391491/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1382847/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1345192/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1297752/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1269529/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:126409/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:126127/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1249839/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1419891/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1229110/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1219505/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1202196/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1196890/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1194325/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1177378/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1078751/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1074313/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1062804/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1056894/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1030500/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:145615/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:202733/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1898577/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1895696/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1888844/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:188679/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1883356/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1861119/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1848990/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1801181/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1717464/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1712599/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1712283/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1691980/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1679377/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1677577/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1652286/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1645105/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1620336/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1480606/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:1452893/1‑62 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCa   >  1:741772/1‑61 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCa   >  1:685253/1‑61 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTAGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGt      >  1:396441/1‑58 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCACAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCaa  >  1:25111/1‑62 (MQ=255) ggATCTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCa   >  1:202607/1‑61 (MQ=255) |                                                              GGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAA  >  minE/1443133‑1443194

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑