Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1443465 1443644 180 10 [0] [0] 60 rcsD phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

AGAAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTG  >  minE/1443645‑1443706
|                                                             
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAGTACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:161873/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCtt   >  1:563893/1‑61 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCtt   >  1:1447268/1‑61 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCtt   >  1:358487/1‑61 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCtt   >  1:1125886/1‑61 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCtt   >  1:697544/1‑61 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:503666/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:193790/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:50242/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:499933/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:47254/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:46132/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:407390/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:248327/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:23815/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:233504/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:197681/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1836783/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:533366/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:614610/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:662892/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:667023/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:67743/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:691822/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:737261/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:749105/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:762693/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:855555/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:859834/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:872188/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:962564/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1460868/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1031849/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1048469/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1053251/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1063478/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1100075/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1113061/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1117993/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1138300/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1141685/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1170149/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1194566/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1263823/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1292211/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:192623/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1476240/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1483121/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1554983/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1568905/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1615677/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1663143/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1669607/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1690161/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1774342/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1776513/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1798350/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1835388/1‑62 (MQ=255)
agaAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTg  >  1:1003589/1‑62 (MQ=255)
agaAGGAAGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCg                            >  1:853064/1‑36 (MQ=255)
|                                                             
AGAAGGATGTTCCAGGAATAGAAAAATACATCAGCGACATTGACAGTTATGTCAAGAGCTTG  >  minE/1443645‑1443706

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: