Missing coverage evidence...
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CAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATAA  >  minE/1455775‑1455836 |                                                              cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:415040/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:98913/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:951358/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:916385/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:900945/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:897627/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:876815/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:782453/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:771013/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:732083/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:715473/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:70710/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:547383/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:52739/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:434703/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:1008555/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:37719/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:1721842/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:1663168/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:1662934/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:165999/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:1652862/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:1600961/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:1574010/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:1279037/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:1189957/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:1146917/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:1059685/62‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCCGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATaa  <  1:1739255/62‑1 (MQ=255) |                                                              CAGGTGCAGATACTCATGGGTTAAATCCAGCCGATCCTGAAGCGTAAAGAAGTTACGAATAA  >  minE/1455775‑1455836

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑