Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1559382	1559720	339	87 [0]	[0] 13	evgA	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with EvgS

CAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTCTCAACCGGTTTGTTGGAAGTTTAACGTCC  >  minE/1559721‑1559782 |                                                              cAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTTTCAACCGGTTTGTTGGAAGTTTAACGTcc  >  1:1112246/1‑62 (MQ=255) cAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTCTCAACCGGTttgtt                 >  1:874154/1‑47 (MQ=255) cAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTCTCAACCGGTTTGTTGGAAGTTTAACGTcc  >  1:1185069/1‑62 (MQ=255) cAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTCTCAACCGGTTTGTTGGAAGTTTAACGTcc  >  1:1227322/1‑62 (MQ=255) cAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTCTCAACCGGTTTGTTGGAAGTTTAACGTcc  >  1:1299724/1‑62 (MQ=255) cAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTCTCAACCGGTTTGTTGGAAGTTTAACGTcc  >  1:1414046/1‑62 (MQ=255) cAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTCTCAACCGGTTTGTTGGAAGTTTAACGTcc  >  1:1738618/1‑62 (MQ=255) cAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTCTCAACCGGTTTGTTGGAAGTTTAACGTcc  >  1:24877/1‑62 (MQ=255) cAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTCTCAACCGGTTTGTTGGAAGTTTAACGTcc  >  1:303820/1‑62 (MQ=255) cAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTCTCAACCGGTTTGTTGGAAGTTTAACGTcc  >  1:364941/1‑62 (MQ=255) cAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTCTCAACCGGTTTGTTGGAAGTTTAACGTcc  >  1:540860/1‑62 (MQ=255) cAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTCTCAACCGGTTTGTTGGAAGTTTAACGTcc  >  1:598519/1‑62 (MQ=255) cAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTCTCAACCGGTTTGTTGGAAGTTTAACGTcc  >  1:666146/1‑62 (MQ=255) |                                                              CAAAAAATGGCTACTGCTATTTCCCCTTCTCTCTCAACCGGTTTGTTGGAAGTTTAACGTCC  >  minE/1559721‑1559782

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑