Missing coverage evidence...
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ACATTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCA  >  minE/1575211‑1575272 |                                                              acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:778554/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:42751/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:4579/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:459885/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:48752/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:503771/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:547938/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:576890/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:714020/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:403775/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:795608/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:811019/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:819704/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:829103/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:880323/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:903631/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:940132/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:978586/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:1831188/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:1127814/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:1214896/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:1264765/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:1269457/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:1390442/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:1491402/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:1675272/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:1696040/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:180086/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:1020426/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:190091/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:199868/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:203366/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:226153/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:275109/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:350621/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:362964/62‑1 (MQ=255) acaTTGCCGTTCCCACTACGCAGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCa  <  1:457232/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACATTGCCGTTCCCACTACGCCGAGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCA  >  minE/1575211‑1575272

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑