Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	139188	139541	354	49 [0]	[0] 29	htrE	predicted outer membrane usher protein

CTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCAC  >  minE/139542‑139604 |                                                               cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCg                >  1:831697/1‑49 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGCCCAGGGGTTTc    >  1:355261/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGTGTTTc    >  1:1356892/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:1785932/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:790656/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:71301/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:667590/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:607487/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:575073/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:500141/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:485048/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:412507/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:239565/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:19140/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:1870263/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:1069647/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:1736535/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:1635667/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:1498051/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:1459268/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:1443774/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:1401077/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:1350710/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:1288745/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:128148/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:1266006/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:1188965/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTc    >  1:1094617/1‑61 (MQ=255) cTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCA‑TTTTTCGACCAGGGGTTTCAc  >  1:548201/1‑62 (MQ=255) |                                                               CTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGTTTCAC  >  minE/139542‑139604

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑