Missing coverage evidence...
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ACTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTGCGG  >  minE/1654724‑1654784 |                                                             aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1800289/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:90807/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:82397/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:799336/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:778099/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:704938/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:677243/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:485258/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:449174/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:434546/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:390205/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:338408/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:276930/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1839118/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1830141/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1007497/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1686820/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1672528/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1612670/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1561238/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1406059/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1400797/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1288392/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1183694/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1094727/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1063917/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1029883/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1028761/61‑1 (MQ=255) aCTGGCTACAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTgcgg  <  1:1342908/61‑1 (MQ=255) |                                                             ACTGGCTGCAAACGGCAGGTAACGTTGAGCACCATGAAATGTATCGCACCTTCAACTGCGG  >  minE/1654724‑1654784

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑