Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1678515	1679104	590	99 [0]	[0] 20	pbpC	fused transglycosylase and transpeptidase

TCGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGACGT  >  minE/1679105‑1679166 |                                                              tcGCCAGTGAGCTTCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:1379114/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGt                         >  1:1844893/1‑39 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:1712014/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:857748/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:808116/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:715832/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:663225/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:38052/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:219805/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:1829786/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:1016794/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:1674501/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:1527743/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:1457341/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:1428063/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:1273849/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:103302/1‑62 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcg   >  1:1668168/1‑61 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcg   >  1:1105124/1‑61 (MQ=255) tcGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTCTTGCGCCAGTTCTTCCAGAcgt  >  1:637935/1‑62 (MQ=255) |                                                              TCGCCAGTGAGCTGCGCGGTGGCAACCGCCCTTTCCAGTTTTGCGCCAGTTCTTCCAGACGT  >  minE/1679105‑1679166

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑