Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1700580 1700891 312 19 [0] [0] 104 [hcaR] [hcaR]

Only 100 of 104 total aligned reads displayed.

GATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGTTT  >  minE/1700892‑1700947
|                                                       
gATTCATGGTCACCATAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:657553/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCCCCTGGACGATATTtggctgg        >  1:855401/1‑50 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGa                      >  1:1770583/1‑36 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGa                   >  1:1637053/1‑39 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:53911/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:671262/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:660322/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:62843/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:624671/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:62290/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:588912/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:578759/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:578533/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:571154/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:672350/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:520150/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:502743/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:498778/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:497874/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:482793/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:460629/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:445715/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:40026/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:374183/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:358958/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1007638/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:759584/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:984600/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:978267/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:951636/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:915344/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:898559/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:894427/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:847044/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:828276/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:814340/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:805951/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:767982/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:354413/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:751307/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:742369/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:727927/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:726113/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:714544/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:706503/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:701249/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:698754/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:695159/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:680525/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:678321/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1209102/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:330887/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1387814/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1381839/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1369962/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1357127/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1346185/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1300107/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1290481/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1288516/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1273846/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1234950/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1229547/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1393487/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1196739/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1190179/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1157548/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1140040/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1139748/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1136986/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1118486/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1099202/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:10785/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1047087/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:101389/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1769592/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:316501/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:287541/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:24085/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:226679/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:191900/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1894300/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1892175/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1889219/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1872015/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1855807/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1809318/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1500942/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1749178/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1748635/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1672735/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1671199/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:163026/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1541485/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1525417/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGttt  >  1:1516650/1‑56 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGtt   >  1:16328/1‑55 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGtt   >  1:709948/1‑55 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGtt   >  1:660580/1‑55 (MQ=255)
gATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTGGCTGGCTGttt  >  1:419919/1‑55 (MQ=255)
|                                                       
GATTCATGGTCACCAGAATATTCGTTGCCACCTGGACGATATTTGGCTGGCTGTTT  >  minE/1700892‑1700947

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: