Missing coverage evidence...
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CAGCAAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGC  >  minE/1995850‑1995911 |                                                              cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTg   >  1:554724/1‑61 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTg   >  1:203738/1‑61 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:1840744/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:898110/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:87855/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:833679/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:793006/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:774976/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:57841/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:578312/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:556989/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:218714/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:1183542/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:1819102/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:1753888/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:1681742/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:1638340/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:1612196/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:1454316/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:1348714/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:1289900/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:119668/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGc  >  1:1194189/1‑62 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTCCTCGTTg   >  1:1462190/1‑61 (MQ=255) cagcaAATTCTCTTCATACTGACAGGCAGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGt     >  1:563438/1‑59 (MQ=255) |                                                              CAGCAAATTCTCTTCATACTGACAGGCTGCGGATTCCAGCTCCAGCCACTGCTGCTCGTTGC  >  minE/1995850‑1995911

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑