Missing coverage evidence...
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CCCTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGC  >  minE/2118548‑2118609 |                                                              cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAggg   >  1:1037078/1‑61 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAggg   >  1:988587/1‑61 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAggg   >  1:882912/1‑61 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAggg   >  1:59513/1‑61 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAggg   >  1:1188064/1‑61 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:634725/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1876802/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1897011/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:353324/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:369561/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:39761/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:4194/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:512245/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1144854/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1783154/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:646997/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:675370/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:721763/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1091090/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:918110/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:934706/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:965250/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1008681/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:170958/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1301758/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1392978/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1441791/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1443838/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1452574/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1467778/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:147922/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1513502/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:159519/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1624259/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1658172/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1693953/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1701972/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:17668/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCGTATTTGCAGGGc  >  1:141906/1‑62 (MQ=255) cccTGATTTTCGCCGGATGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGc  >  1:1278478/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCCTGATTTTCGCCGGTTGTGGCACCCATACTCCCGATCAGTCCACTGCTTATATGCAGGGC  >  minE/2118548‑2118609

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑