Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2142023	2142315	293	98 [0]	[1] 96	nusA	transcription termination/antitermination L factor

AAGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATA  >  minE/2142315‑2142376  |                                                             aaGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:788594/62‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCAtt  <  1:1681237/61‑2 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:500422/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:669689/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:640787/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:636646/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:59298/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:580403/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:571298/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:560195/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:559482/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:51815/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:500799/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:720087/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:497477/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:490357/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:459061/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:437794/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:42142/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:420938/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:410696/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:365039/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:357603/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:347592/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:336917/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:858794/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:996429/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:989915/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:968509/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:958301/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:95165/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:948975/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:928455/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:928125/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:914202/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:882052/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:874665/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:691908/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:853355/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:834789/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:83215/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:831688/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:829522/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:815439/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:80495/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:796985/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:758734/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:755904/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:334493/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1401901/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1602849/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1591704/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1589157/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1588017/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1577770/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:150714/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:148209/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1453899/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1442643/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1432800/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1408787/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1618370/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1390546/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1308851/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1285850/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1226772/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1159751/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1145692/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1133480/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1127972/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1026508/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1026359/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1026333/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1839723/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:323398/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:314021/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:301977/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:298067/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:252579/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:252064/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1891194/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1874945/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1859836/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1856228/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1846356/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:100837/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1836673/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1817345/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1812159/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1770013/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1736965/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1716085/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:170129/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1660351/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1638433/61‑1 (MQ=255)  aGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATAGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATa  <  1:1656357/61‑1 (MQ=255)  |                                                             AAGGTAACAGACTCAATCTGATCTTCAACGTAATCGCCCAGGTTCAGGCTTTCATCTTCATA  >  minE/2142315‑2142376

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑