Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2238677	2238802	126	10 [0]	[0] 31	zraR	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with ZraS

CGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCTTT  >  minE/2238803‑2238863 |                                                             cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:379227/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:994932/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:977408/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:96199/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:883375/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:876760/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:785522/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:709715/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:681262/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:634979/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:563719/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:532329/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:530798/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:524337/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:468952/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:393585/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1037839/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1872873/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1854376/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1850288/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1845726/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1834442/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1775969/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1648271/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1613926/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1567630/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1448144/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1420219/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1349549/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1325770/61‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCttt  <  1:1060227/61‑1 (MQ=255) |                                                             CGCTGGAGTACGCAGTCATAATCAGCACCGGAATTGCCGGGTTTAACGCTTTGATCTCTTT  >  minE/2238803‑2238863

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑