Missing coverage evidence...
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AAGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCA  >  minE/2251774‑2251835 |                                                              aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:617223/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:305073/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:335117/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:408138/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:40906/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:469775/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:480275/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:49099/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:509085/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:553695/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:197319/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:658369/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:694922/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:760202/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:787294/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:83550/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:876199/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:907165/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:90745/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:99569/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1354177/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1069773/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1115141/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1128194/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1131668/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1141385/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1163431/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1181786/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1189652/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1212508/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1052601/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1444807/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:150924/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1521007/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1547908/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1558040/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1593002/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1662477/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1764038/62‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCa  <  1:1791387/62‑1 (MQ=255) |                                                              AAGCTTCTTCCTCGTTTCGCCCTGCCTTTCTTAAAAATTCCGTAATGCAAAGTCTGAAGCCA  >  minE/2251774‑2251835

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑