Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2257961	2258089	129	41 [0]	[0] 98	rpoB	RNA polymerase, beta subunit

TACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTCCA  >  minE/2258090‑2258150 |                                                             tACTGCTCATCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:450673/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCGGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:766440/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTTCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:129375/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCa              >  1:1204330/1‑49 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAg       >  1:282026/1‑56 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:607693/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:647322/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:583520/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:567912/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:550282/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:540513/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:533211/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:50919/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:487658/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:441925/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:410381/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:406048/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:343603/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:340676/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:329365/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:325924/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:302486/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:280165/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:194183/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1895665/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1007255/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:761495/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:982197/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:947284/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:945967/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:914389/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:908618/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:863464/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:847490/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:843886/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:836467/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:792459/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:767276/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:607877/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:721708/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:715933/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:713460/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:700151/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:697903/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:683690/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:663214/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:650536/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1834286/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:620508/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1246920/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1457316/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:14557/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1427683/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1423562/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:14189/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1388579/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1346369/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1303894/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:129592/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1286731/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1258764/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1474006/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1228564/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1176962/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1159861/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:113871/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1128049/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1102583/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1067404/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1064011/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1047110/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1031875/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1031713/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1578868/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1784702/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1772471/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1701234/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1690598/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1672023/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1657395/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1651087/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1630814/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1611830/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1592626/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1590679/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:182465/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1578013/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1577467/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1574356/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1553646/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1552598/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1529255/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1521722/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1517419/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:1502531/1‑61 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcc   >  1:628851/1‑60 (MQ=255) tACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGAATTTGTTtct                          >  1:315487/1‑37 (MQ=255) tACTGATCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTcca  >  1:50694/1‑61 (MQ=255) |                                                             TACTGCTCAGCCAGCTGTTCCAGCTGATTTTGTTTCTCTTCGTCTGTCAGGCCCAGCTCCA  >  minE/2258090‑2258150

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑