Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2260009	2260009	1	35 [0]	[0] 33	rpoB	RNA polymerase, beta subunit

CGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCA  >  minE/2260010‑2260064 |                                                       cGAGTGGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:1580233/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTTCGCTCa  <  1:354270/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:781044/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:434305/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:501455/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:558553/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:59401/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:759966/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:775018/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:288802/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:788030/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:818782/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:834844/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:865131/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:913456/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:914722/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:977902/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:351918/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:1005510/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:282269/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:235740/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:217177/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:1777930/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:1747522/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:1567320/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:1539962/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:1439815/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:1266679/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:1189248/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:1168031/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:1127390/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:112597/55‑1 (MQ=255) cGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCa  <  1:1074253/55‑1 (MQ=255) |                                                       CGAGTCGGCGGCTCGCCAGGGCGCATCATGCGGTAGATTTCTACCAGTGCGCTCA  >  minE/2260010‑2260064

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑