Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2319558	2319684	127	170 [0]	[0] 92	[yiiR]	[yiiR]

CTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTACAAC  >  minE/2319685‑2319746 |                                                              cTGTCTATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1160925/62‑1 (MQ=255) cTGTCTATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1243615/62‑1 (MQ=255) cTGTCACTGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1244082/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTTTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:241016/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:582699/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:622476/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:578954/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:575438/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:550885/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:548709/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:54718/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:545677/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:5443/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:536485/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:516376/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:50698/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:491011/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:483797/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:471611/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:444763/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:439590/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:425893/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:405649/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:396314/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:388971/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:38387/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:821180/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:975630/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:967861/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:947562/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:945321/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:941705/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:911246/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:906181/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:902753/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:857888/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:846969/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:619455/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:794022/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:77938/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:746836/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:740161/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:685265/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:670151/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:636798/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:636576/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:634312/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:329165/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1193937/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:356153/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1522611/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1457522/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:143970/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1396510/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1375467/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1339841/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1322416/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1320101/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1249819/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:152744/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:118732/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1171109/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1154938/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:113019/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1094537/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1088110/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1085243/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1031870/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1022867/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1020747/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1764349/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:346800/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:100305/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:243737/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:224375/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:211011/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:207326/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1887211/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1863975/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1863257/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1859318/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:156110/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1731002/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1686422/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1656775/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:163594/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1619302/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1605582/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1589816/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1573847/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:1573205/62‑1 (MQ=255) cTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTATTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTacaac  <  1:140563/62‑1 (MQ=255) |                                                              CTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGTTCTGCATTAACCGTTACAAC  >  minE/2319685‑2319746

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑