Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2319747	2319831	85	97 [0]	[0] 74	yiiQ	conserved hypothetical protein

CAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCAT  >  minE/2319832‑2319893 |                                                              cAGTTTCGAGAATACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1221826/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGTCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:418457/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGTACGAATTTCGTGCCa   >  1:110175/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGcc    >  1:1174790/1‑60 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGcc    >  1:583670/1‑60 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGcc    >  1:750601/1‑60 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGcc    >  1:1729286/1‑60 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:35792/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:398140/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:353457/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:4114/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:692218/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:316709/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:253198/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:446622/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:455090/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:190817/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:462818/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:467316/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:513006/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:556062/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1866941/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:844141/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:959283/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:958922/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:921787/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:916444/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:910114/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:895065/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:854125/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:845582/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:581280/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:835757/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:792490/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:7750/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:737533/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:718142/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1796851/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:665783/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:111731/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1427996/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1372565/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1343564/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1323238/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1303124/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1301550/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1280976/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1273190/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1442308/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1084480/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1069930/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1062822/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:10585/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1047818/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1035715/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:101578/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1006209/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1630711/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1803909/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1005298/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1778378/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1748720/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1740793/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1711632/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1702845/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1811777/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:158902/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1566683/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1541197/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1513953/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1500278/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:148225/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCa   >  1:1453506/1‑61 (MQ=255) cAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCAt  >  1:1724257/1‑62 (MQ=255) |                                                              CAGTTTCGAGAAGACTTTAACAGCCAGAATCCCAGCCTGCCACTGAACGAATTTCGTGCCAT  >  minE/2319832‑2319893

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑