Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2326819 2327402 584 156 [0] [1] 74 [cpxR]–[cpxA] [cpxR],[cpxA]

AACTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCGCTG  >  minE/2327401‑2327463
  |                                                            
aaCTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGTCAGTACGCCgctg  <  1:1580874/62‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGGCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1784834/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:234627/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:491390/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:406154/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:400476/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:367317/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:346194/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:333949/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:311246/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:258719/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:531538/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:213958/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:196965/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1861828/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1825209/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1806928/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1766555/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1047026/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:736188/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:973512/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:972082/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:96579/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:955273/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:915350/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:79946/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:794786/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:75492/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1740785/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:723663/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:646635/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:622095/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:597160/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:592865/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:579542/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:542730/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:532821/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1229816/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1400723/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1336870/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1336445/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1322753/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1293046/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:12926/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1290746/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1273798/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1261628/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1733427/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:121011/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1155648/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1148204/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1137321/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1130147/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1127971/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1097488/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:106351/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1606547/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1734982/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1716494/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:171393/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1706947/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1702209/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1666654/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1664093/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1628539/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1546372/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1482217/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1460439/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1440047/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1416689/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1414955/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACCCCgctg  <  1:497513/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCAAGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:1436444/61‑1 (MQ=255)
  cTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATCGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCgctg  <  1:522341/61‑1 (MQ=255)
  |                                                            
AACTTACTGTTTGACCGCCCGCTATTACTGCTGATTGTCACCATGTTGGTCAGTACGCCGCTG  >  minE/2327401‑2327463

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: