Missing coverage evidence...
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AGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGT  >  minE/2338930‑2338990 |                                                             aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTTCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:443605/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:1811031/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:971458/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:904536/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:788596/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:787327/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:502110/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:465728/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:451789/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:416624/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:37610/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:249058/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:21740/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:201959/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:181351/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:1075689/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:1742975/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:1657116/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:164045/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:162755/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:1583469/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:154576/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:1530379/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:1522783/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:1508398/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:1431798/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:1413729/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:1177234/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:1176298/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:1108531/61‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGACTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGt  <  1:433399/61‑1 (MQ=255) |                                                             AGGTCGCCTTTACGTTCGCCCAGCGCCTGCATTACAGAACCCTGATGCTGTTCTTCAACGT  >  minE/2338930‑2338990

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑