Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2340344 2340389 46 52 [1] [1] 113 bipA/glnA GTP‑binding protein/glutamine synthetase

Only 100 of 113 total aligned reads displayed.

AAGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATG  >  minE/2340389‑2340450
 |                                                            
aaGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCTCATg  <  1:433451/62‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCATATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:675706/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATGGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:209364/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACTATGGTGCGCATg  <  1:1167060/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCacg  <  1:597324/61‑3 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:438622/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:679637/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:670461/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:665359/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:622108/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:597858/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:556204/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:529312/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:494044/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:479097/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:478499/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:456163/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:273456/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:271925/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:416776/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:402819/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:383083/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:350699/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:332849/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:330805/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:325264/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:278288/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:884787/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:988814/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:97936/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:978952/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:970036/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:966031/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:961824/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:959836/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:934163/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:908168/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:902462/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:897805/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:267443/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:875369/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:862902/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:858971/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:830267/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:82714/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:789226/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:786567/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:764585/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:728161/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:721106/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:716750/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1271398/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1528005/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1524945/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1483020/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1457087/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1439490/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1436711/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1418029/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1400652/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1374388/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1360641/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1306786/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1291925/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1561864/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1240288/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1220458/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1194263/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1170717/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1139370/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1106300/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1097906/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1068445/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1058407/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1058169/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1049502/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1787125/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:224805/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:215704/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:194924/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:192895/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1896630/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1875556/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1871221/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1843485/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1838447/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1833248/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1008683/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1698069/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1680322/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1669650/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:163243/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1622595/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1604358/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1599966/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1586843/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:157376/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGAGCATg  <  1:38107/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGCGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1695205/61‑1 (MQ=255)
 aGCACTATATTGGTGCAACAATCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATg  <  1:1780245/61‑1 (MQ=255)
 |                                                            
AAGCACTATATTGGTGCAACATTCACATCGTGGTGCAGCCCTTTTGCACGATGGTGCGCATG  >  minE/2340389‑2340450

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑