Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2360836–2361195	2363078–2363006	1812–2243	187 [0]	[0] 64	[rrlA]–[rrsA]	[rrlA],alaT,ileT,[rrsA]

ATTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGA  >  minE/2363079‑2363140 |                                                              aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:625583/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:307531/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1039007/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:34838/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:404481/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:411407/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:414976/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:425939/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:441252/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:452685/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:453697/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:513148/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:550066/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:564783/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:60680/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:624897/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:344731/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:627064/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:67227/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:707297/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:711930/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:750305/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:79694/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:855152/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:875491/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:908509/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:949217/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:954239/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:964398/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:972514/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:999594/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1655050/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1040415/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1067899/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1200112/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1256802/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1353426/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1482541/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1486663/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1500866/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:153819/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1587967/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1611324/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1613026/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:293947/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1695544/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1837140/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:275181/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:239992/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:217255/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:192523/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1899326/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1892342/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1695969/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1832616/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1783355/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1768136/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1729104/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1723519/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1712684/1‑62 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTgag   >  1:730974/1‑61 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTg     >  1:950523/1‑59 (MQ=35) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTAAGTGTTCACTCTTgaga  >  1:1125442/1‑62 (MQ=25) aTTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATCACGTGTTCACTCTTgaga  >  1:676610/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATTTAAAAGTTTGACGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGA  >  minE/2363079‑2363140

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑