Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2380645	2380750	106	45 [0]	[0] 21	rmuC	predicted recombination limiting protein

AGATTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTG  >  minE/2380751‑2380812 |                                                              agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCt   >  1:1469245/1‑61 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:177816/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:995919/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:953429/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:874319/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:723435/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:533715/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:382760/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:295087/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:244065/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:194809/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:184521/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:1063920/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:1753223/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:1604647/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:1480330/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:1423430/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:1302069/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:1142776/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:1134146/1‑62 (MQ=255) agaTTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTg  >  1:1090590/1‑62 (MQ=255) |                                                              AGATTGCGAATTTCGTGGGTCAGGGTATGGCGTTCTTGTGCTTCTTTACCGAAGCTGTCCTG  >  minE/2380751‑2380812

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑