Missing coverage evidence...
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CGCCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAT  >  minE/2388845‑2388906 |                                                              cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGGCCAGTTGAGGAt  <  1:1384887/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTTAGGAt  <  1:789238/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:1719641/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:930083/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:697077/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:635632/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:632102/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:489827/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:428/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:273892/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:241599/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:24120/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:1835822/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:1129899/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:1686195/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:1685138/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:164383/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:1545314/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:1497498/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:1391195/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:1378683/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:1263742/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:1159029/62‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCAAGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAt  <  1:1527602/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGCCCGGTGCCTATTGCATAGCCATCACGGAAACGTGGATGCGCTTCGGCCCAGTTGAGGAT  >  minE/2388845‑2388906

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑