Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2402221 2402231 11 112 [0] [0] 172 xerC site‑specific tyrosine recombinase

Only 100 of 172 total aligned reads displayed.

TGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGT  >  minE/2402232‑2402295
|                                                               
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAg                               >  1:76900/1‑35 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGgcg                         >  1:1326460/1‑41 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTGCACGCTCAGATAACgta     >  1:1418714/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgtag    >  1:169162/1‑62 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:414363/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:617776/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:601222/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:57824/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:577680/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:544883/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:534776/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:531177/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:507843/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:484314/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:427891/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:671556/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:383099/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:366094/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:35628/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:351689/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:329311/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:312085/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:246883/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:236351/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:225897/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:213344/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:195627/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:843457/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:975336/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:968392/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:953264/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:950901/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:931941/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:919850/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:901114/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:894761/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:892568/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:860008/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:859692/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:632387/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:80596/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:79668/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:79300/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:776/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:765796/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:762928/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:748640/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:717179/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:698798/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:18712/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:6348/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1237310/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1873846/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1452865/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1450269/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1428582/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:141197/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1401817/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1369430/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1358952/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1290106/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1274114/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1256207/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1486665/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1221674/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1220883/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1164121/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1141875/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:114105/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1134563/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1100100/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1075586/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1062103/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1046781/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1033711/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1644915/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:102350/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1858840/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1799575/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1776634/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1771503/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1758063/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1755985/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1741501/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1712291/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:167258/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:162900/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1611135/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1583369/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1524561/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1521490/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:151188/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1506852/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1495608/1‑61 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgt      >  1:434487/1‑60 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgt      >  1:1493337/1‑60 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACg       >  1:1773770/1‑59 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTAAGa            >  1:1413465/1‑54 (MQ=255)
tGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGATCCACGCTCAGATAACgta     >  1:1683702/1‑61 (MQ=255)
tGACGCGGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACgt      >  1:1344998/1‑60 (MQ=255)
|                                                               
TGACGCTGGTAGTTAAGCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGT  >  minE/2402232‑2402295

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: