Missing coverage evidence...
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CATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAC  >  minE/2407937‑2407998 |                                                              cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1717985/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:98080/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:951034/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:891770/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:807166/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:625793/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:423244/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:328116/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:30000/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:282755/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:265045/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:223385/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:220056/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1889903/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1814693/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1783466/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1000654/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:171003/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1703979/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1666506/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1664007/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1632190/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:147160/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1443539/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1388869/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1352948/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1244134/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1228027/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1140944/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1061818/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:1060166/62‑1 (MQ=255) cATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAc  <  1:103884/62‑1 (MQ=255) |                                                              CATCCGGGCCTGGTCGTTGAACTGGTACCGATGGTGACGCGCGGCGATGTGATTCTTGATAC  >  minE/2407937‑2407998

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑