Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2442674	2443244	571	109 [0]	[0] 43	ilvA	threonine deaminase

CCTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTA  >  minE/2443245‑2443306 |                                                              ccTTCCTGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGAtt    >  1:1140431/1‑60 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCatta                        >  1:1782673/1‑40 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCAttatta                     >  1:901502/1‑43 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTACCCCCCCAGTTTCGAttt   >  1:178120/1‑61 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGttt         >  1:1587235/1‑55 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGAttt   >  1:287607/1‑61 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1873739/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:9564/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:236693/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:289044/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:318923/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:36722/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:369457/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:385424/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:422421/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:434563/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:504546/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:603287/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:629846/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:662624/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:698485/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:896855/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1063278/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1496289/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1148476/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1156869/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1160660/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1210737/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1322811/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1368407/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1432654/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1467657/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1474700/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:187163/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1511858/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1525772/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1607001/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1623224/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1624053/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1761866/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:1814857/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTa  >  1:186464/1‑62 (MQ=255) ccTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGAGTTa  >  1:317564/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCTTCCGGAGCACCGGACAGGGGTTGCGAGTCAGCCATTATTAACCCCCCAGTTTCGATTTA  >  minE/2443245‑2443306

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑